El proceso, por narcotráfico, tiene como telón de fondo la posible participación del mandatario en esta trama delictiva.
Los cubanos son casi la mitad del total de extranjeros interceptados por las autoridades de ese país.
Desde que su hermano fue declarado culpable de narcotráfico, se esperaban acusaciones sobre Juan Orlando Hernández.
"Para ser claros, estas acciones no significan que la frontera de Estados Unidos esté abierta", dijo el secretario de Estado, Antony Blinken.
Las autoridades de Honduras detienen a 18 emigrantes de la Isla, dos de ellos menores.
No surtió efecto el juicio político contra quien ha sido señalado de inconstitucional y de relaciones con el narcotráfico.
Los cubanos permanecen retenidos en una oficina del Instituto Nacional de Migración en Choluteca, Honduras.
Los aproximadamente 9.000 migrantes se dirigen a EEUU para escapar de la violencia y la pobreza que afecta a Honduras.
Los centroamericanos acusan a las autoridades mexicanas de beneficiar en los trámites a los cubanos.
Medios oficialistas cubanos anuncian envío de galenos a Honduras, pero callan sobre el envío de alimentos e insumos médicos.
